林木基因组学与分子育种首席专家组

发布者: [发表时间]:2021-03-19 [来源]: [浏览次数]:

本团队致力于热带林木、花草、药用植物等的基因组学与分子育种研究,借助国家林业和草原局热带林业研究重点实验室的科研平台,为热带林木、花草、药用植物等的品种鉴定、良种选育等提供技术支撑。

1. 主要成员与简介

首席专家:甘四明,研究员

家:李发根,研究员

家:翁启杰,高级工程师

专家助理:李梅副研究员

博士研究生:吕佳斌、李丹丹、陈新华、郝丙青(在职)

硕士研究生:朱显亮、邱研、王平

甘四明,男,博士,研究员,博士生导师。1992毕业于武汉大学生物学系,获理学学士学位;1995年毕业于中国林业科学研究院林木遗传育种专业,获农学硕士学位;1999年毕业于南京林业大学林木遗传育种专业,获农学博士学位。2001~2002年在澳大利亚CSIRO林研所开展博士后研究。19958月开始在中国林科院热带林业研究所工作,主要从事热带速生树种和经济林树种的基因组学与分子育种研究。已承担国家自然科学基金、广东省自然科学基金、教育部留学回国人员科研启动基金、863课题、973课题、科技支撑计划课题和重点研发计划课题等10余项。已发表研究论文100余篇,包括SCI源刊物发表30余篇;获得国家发明专利2项;获得省级林木审定良种1项;植物新品种权5项。已指导博士毕业生11名、硕士毕业生10名。兼任国际桉树基因组协作网成员、中国林学会桉树专业委员会常委、中国林学会林木遗传育种分会第八届委员会委员、广东省本科高校林学类教学指导委员会委员、《南京林业大学学报(自然科学版)》编委和《广西林业科学》编委。

李发根,男,博士,研究员。2000年毕业于江西农业大学林学系,获农学学士学位。2003年毕业于中国科学院华南植物研究所,获理学硕士学位。2010年毕业于中国林业科学研究院林木遗传育种专业,获农学博士学位。20037月开始在中国林科院热带林业研究所工作,主要从事热带速生树种的基因组学与分子育种研究。

翁启杰,男,硕士,高级工程师1987年毕业于广东省林业学校1999年毕业于华南农业大学,获农学学士学位;2008年毕业于中国林业科学研究院森林培育专业,获农业推广硕士学位。19877月开始在中国林业科学研究院热带林业研究所工作,早期从事热带树种引种、栽培和乡土珍贵阔叶树种栽培与经营技术研究,现主要从事热带林和药用植物的分子育种研究,在利用近红外光谱技术对尾细桉、大花序桉和细叶桉的木材材性、化学成分含量分析等方面有较强优势。参加科研项目20以第一作者发表论文20篇,参加发表论文50余篇;参加完成国家发明专利3桉树新品种5省级桉树良种1个;曾获广东省农业技术推广二等奖一项、广东省科技进步三等奖一项,海南省科技进步二等奖一项、广西梧州市科技进步一等奖一项。

李梅,女,博士,副研究员2001年毕业于南京林业大学,获农学博士学位20017月开始在中国林业科学研究院热带林业研究所工作早期主要从事科技管理工作并兼顾热带林木遗传育种研究,2015年开始专职科研工作,主要从事桉树基因组学与药用树种猴耳环的资源收集、栽培、分子评价和良种选育等研究。主持科研项目5项,参加科研项目10余项以第一作者撰写发表论文8篇,参加发表论文40余篇主持完成广东省地方标准1,参加完成林业行业标准和广东省地方标准各1;参加完成国家发明专利2桉树新品种5桉树省级良种1;参与完成认定成果2

2. 科研方向与在研课题

主要科研方向为林木基因组学与分子育种。重点以桉树和油茶等树种为材料,利用基因组学和代谢组学等技术解析基因组特征以及影响重要经济性状形成和群体适应进化的基因组学基础,并为分子育种提供基因组资源、构建林木基因组学辅助育种的技术体系。5年在研课题包括国家重点研发计划、广东省科技计划、广东省自然科学基金、广西创新驱动专项和院所基金等13项。

(1) 中国林业科学研究院基本科研业务费专项资金CAFYBB2021ZA001不同纬度上林木异速生长适应性分化研究2021-2025130万元,在研,主持;

(2) 中国林业科学研究院基本科研业务费专项资金CAFYBB2021SY001木相思和大花序桉心材特性及形成机制研究2021-202420万元,在研,参加;

(3) 广东省自然科学基金,2020A1515010974,整合QTLRNA-seq的桉树材性候选功能基因挖掘及验证,2019-202210万元,在研,主持;

(4) 广西壮族自治区创新驱动专项(桂科AA17204087-3)子课题,桉树主要树种种质创新及繁育关键技术研究,2017-202095万元,在研,主持;

(5) 国家十三五重点研发计划任务,2016YFD0600101,林木次生生长的基因组学基础,2016-2020110万元,在研,主持;

(6) 中国林业科学研究院基本科研业务费专项资金,CAFYBB2018SY019,猴耳环种质资源的遗传评价,2018-202030万元,在研,主持;

(7) 广东省科学技术厅社会发展领域公益研究与能力建设资金,2017A020213002,重要南药树种猴耳环种质资源保护和扩繁技术研究,2017-202030万元,在研,主持;

(8) 中国林业科学研究院基本科研业务费专项资金,CAFYBB2017MA006高杂合基因组尾叶桉杂合校正及功能注释研究,2017-201935万元,已结题,主持;

(9) 广东省林业科技创新专项,2016KJCX014,利用QTL精细定位加速桉树人工林品质改良,2016-201830万元,已结题,主持;

(10) 中国林业科学研究院基本科研业务费专项资金,RITFYWZX201403,基于全基因组序列的桉树比较基因组研究,2014-201750万元,已结题,主持;

(11) 国家863计划任务,2013AA102705,桉树、鹅掌楸转基因育种技术研究,2013-2017268万元,已结题,主持;

(12) 国家自然科学基金面上项目,31270702,巨桉抗枝瘿姬小蜂候选基因的筛选和关联分析,2013-201684万元,已结题,主持。

(13) 973计划任务,2012CB114505,木材品质性状QTL定位、解析与克隆,2012-201688万元,已结题,主持。

3. 科研成果

(I) 良种/新品种

(1) 甘四明,周长品,翁启杰,李发根,李梅,汤建福,王炳南,周建清,洪长福热桉5号,植物新品种2020.07.29,国家林业和草原局,新品种权号20200043

(2) 甘四明,李发根,翁启杰,周长品,李梅,汤建福,王炳南,周建清,洪长福热桉4号,植物新品种,2020.07.29,国家林业和草原局,新品种权号20200042

(3) 甘四明,翁启杰,汤建福,王炳南,周长品,李发根,李梅,周建清,洪长福热桉3号,植物新品种,2020.07.29,国家林业和草原局,新品种权号20200041

(4) 甘四明,翁启杰,李发根,李梅,吴坤明,吴菊英,洪长福,陈国彪,林东升热桉2号,植物新品种,2015.12.25,国家林业局,新品种权号20150174

(5) 甘四明,翁启杰,李发根,李梅,吴坤明,吴菊英,洪长福,陈国彪,林东升热桉1号,植物新品种,2015.12.25,国家林业局,新品种权号20150173

(II) 授权发明专利

(1) 周长品,李昌荣,李发根,翁启杰,陈升侃,王莉,甘四明用于鉴定桉树无性系的STR引物及其应用,2020.10.30中国,ZL201710671363.1

(2) 周长品,李昌荣,李发根,翁启杰,陈升侃,王莉,甘四明用于鉴定桉树无性系的STR引物、PCR试剂盒及方法,2020.10.30中国ZL201710761216.3

(III) 制修订标准

李梅,黄世能,陈祖旭,施国政,李樨,胡文强,张迪,马星宇,金文云,闫晶晶,DB44/T 2217—2019,猴耳环实生苗培育技术规程,广东省地方标准,广东省市场监督管理局,2019123日发布,202033日开始实施

4. 期刊论文

5年发表的主要论文(#同等贡献; *通讯作者)

(1) 甘四明. 林木分子育种研究的基因组学信息资源述评。南京林业大学学报(自然科学版), 2020, 44(4): 1-11.

(2) Lv J#, Li C#, Zhou C#, Chen J, Li F, Weng Q, Li M, Wang Y, Chen S, Chen J, Gan S*. 2020. Genetic diversity analysis of a breeding population of Eucalyptus cloeziana F. Muell. (Myrtaceae) and extraction of a core germplasm collection using microsatellite markers. Industrial Crops and Products, 145: 112157.

(3) Zhou C#, Wang L#, Weng Q, Li F, Li M, Chen J, Chen S, Lv J, Li D, Li C*, Gan S*. 2020. Association of microsatellite markers with growth and wood mechanical traits in Eucalyptus cloeziana F. Muell. (Myrtaceae). Industrial Crops and Products, 154: 112702.

(4) Chen S#, Zhou C#, He X#, Weng Q, Li F, Li M, Guo Y, Gan S*. 2020. Enhanced correlations of EST-SSR based genetic distance with hybrid performance, specific hybridizing ability and heterosis using effect-increasing and effect-decreasing alleles: a case study in Eucalyptus L'Hér.. Tree Genetics & Genomes, 16(1): 16.

(5) Zhang M#, Zhou C#, Song Z#, Weng Q, Li M, Ji H, Mo X, Huang H, Lu W, Luo J, Li F*, Gan S*. 2018. The first identification of genomic loci in plants associated with resistance to galling insects: a case study in Eucalyptus L’Hér. (Myrtaceae). Scientific Reports, 8: 2319.

(6) Chen S, Weng Q, Li F, Li M, Zhou C*, Gan S*. 2018. Genetic parameters for growth and wood chemical properties in Eucalyptus urophylla ´ E. tereticornis hybrids. Annals of Forest Science, 75(1): 16.

(7) Xu X#, Zhou C#, Zhang Y, Zhang W, Gan X, Zhang H, Guo Y, Gan S*. 2018. A novel set of 223 EST-SSR markers in Casuarina L. ex Adans.: polymorphisms, cross-species transferability, and utility for commercial clone genotyping. Tree Genetics & Genomes, 14(2): 30.

(8) Yang H, Weng Q, Li F, Zhou C, Li M, Chen S, Ji H, Gan S*. 2018. Genotypic variation and genotype-by-environment interactions in growth and wood properties in a cloned Eucalyptus urophylla ´ E. tereticornis family in southern China. Forest Science, 64(3): 225-232.

(9) Li C, Weng Q, Chen J-B, Li M, Zhou C, Chen S, Zhou W, Guo D, Lu C, Chen J-C, Xiang D*, Gan S*. 2017. Genetic parameters for growth and wood mechanical properties in Eucalyptus cloeziana F. Muell. New For, 48(1): 33-49.

(10) Song Z#, Zhang M#, Li F, Weng Q, Zhou C, Li M, Li J, Huang H, Mo X*,Mo X*, Gan S*. 2016. Genome scans for divergent selection in natural populations of the widespread hardwood species Eucalyptus grandis (Myrtaceae) using microsatellites. Scientific Reports, 6: 34941.

(11) Yu X, Zhou C*, Li F, Weng Q, Yang H, Li M, Gan S*. 2016. A novel set of 144 EST-InDel markers in Eucalyptus L'Hérit.: polymorphisms, cross-species amplification, physical positions and genetic mapping. Molecular Breeding, 36(7): 104.